La ciudad de Lima padece la invasión de un virus que en apenas unas horas termina con la vida de las personas, al parecer una enfermedad extraña e indescifrable para la medicina, pero altamente contagiosa. Eusebio, como declara el título del film, es el limpiador, quien tras la muerte de alguna persona pasa por allí para desinfectar y limpiar los rastros del virus y de sangre. En una de esas limpiezas encuentra a Joaquín, un niño de ocho años cuya madre fallece a causa del virus. Sin orfanato disponible para poder dejar al niño, Eusebio no encuentra otra alternativa más que alojarlo en su humilde casa e intentar buscar a algún familiar.